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出售厂房而缴纳的增值税应计入的科目是固定资产清理科目。当企业出售厂房时，需要缴纳增值税，该增值税属于固定资产处置过程中产生的税费，因此应将其纳入固定资产清理的核算中。最终，固定资产清理科目的余额可以转入企业的营业外收入或营业外支出中。

仅供参考，关于增值税的会计处理可能因具体情况而有所不同，如果需要更具体的指导，建议咨询专业的会计或财务领域专家。